Винаги опаковайте отново сиренето в прясна опаковка, за предпочитане във восъчна, пергаментова или специална хартия за сирене, след като сиренето е било отворено, за да избегнете изсъхването на сиренето или поемането на други аромати. Не забравяйте, че натуралното сирене е жив организъм, с ензими и бактерии, които се нуждаят от въздух и влага, за да оцелеят. По този начин повторното опаковане на сиренето в хартия и след това в найлоново фолио, за да се създаде микросреда за сиренето, е предпочитаната обработка за съхранение. Въпреки това, не трябва да оставяте сиренето в едни и същи опаковки за продължителни периоди от време.
Препоръчителният температурен диапазон за съхранение на сирене е между 2ºС и 7ºС, при високо ниво на влажност, за предпочитане в долния контейнер за зеленчуци/плодове. За да избегнете случайно замразяване на сиренето, не го съхранявайте близо до фризера или в контейнера за месо.
Увийте двойно силни, пикантни сирена, като синьо, отлежало сирене или сортове с измита кора, за да избегнете проникването на ароматите им в други храни. Най-добре е да поставите тези сирена в херметически затворен контейнер за допълнителна сигурност срещу изтичане на аромат. И най-добре е да съхранявате сирената отделно, ако е възможно, особено сирената, измитите кори и по-меките сирена, тъй като те взаимно ще поемат вкусовете си.
Ако сирена, различни от пресни сирена, са с изтекъл срок на годност (отпечатан върху опаковката) или ако сиренето развие синьо-зелена плесен отвън, направете разрез на около 1½ см под горната повърхност, за да сте сигурни, че са напълно отстранени количествата с лошото качество; останалото сирене ще е добре.
По принцип никога не замразявайте естествените сирена, тъй като те могат да загубят текстурата си, а в някои случаи техните вкусови профили ще бъдат сериозно променени. Ако трябва да замразите сирене, когато трябва да го използвате оставете го да се размрази бавно в хладилника и го използвайте за готвене, тъй като текстурата ще стане ронлива и суха след размразяването му.
Ако съхраняваните и опаковани сирена са прекалено сухи, имат лигава текстура, проявяват миризми на амоняк или някакви неприятни миризми, най-добре е да ги изхвърлите. Ако откриете тези характеристики в сирената в местния магазин, не ги купувайте, тъй като те са с изтекъл срок на годност.